1. 产品简介:
菁染料是性能优良的荧光标记染料,摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的,其琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂,广泛用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度, 可改变其荧光发射波长,每增加一个双键,按照huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料cy3和cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物;另外,cy5, cy5.5和cy7的吸收在近红外区背景非常低,是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。
2. 菁染料琥珀酰亚胺酯(cydye nhs)的标记
菁染料和生物分子的比例f/p=4~12之间荧光强度最高,f/p值过高荧光探针会自我淬灭并影响生物分子的生物活性,标记生物分子最好是用单琥珀酰亚胺酯,但是用双修饰的cydye nhs并没有发现交联。cydye nhs标记抗体在ph (8.5~9.4)时10分钟f/p可达5~6,而在ph 7.0几乎不反应。我们用不同比例的cy3标记anti-glutathione-s-transferase (gst)多克隆抗体发现用1:1, 5:1, 10:1 和20:1标记时得到的f/p值分别是0.28:1, 1.16:1, 2.3:1 和4.6:1。
3. 操作步骤
3.1 水溶性cy5 nhs标记(d-ser2)-leucineenkephalin
1. cy5 nhs 1.0 mg 溶解于400 μl dmso后,加入到1ml 的玻璃瓶中盛有(d-ser2)-leucine-enkephalin acetate (ysgflt, 0.75 mg) 的400 μl dmso溶液。(dye 和peptide 投料比是1:1)
2. 然后加入15 μl三乙胺,常温避光搅拌反应混合物过夜。
3. 用hplc纯化蛋白,使用蛋白c18柱子(25 cm×10 mm),每次上样注入2×400 μl,30分钟梯度洗脱从0.1% tfa水溶液到mecn∶h2o(0.1% tfa)=70∶30,流速4ml /min。(对不同的蛋白选择不同的合适hplc梯度流动相)
4. 收集适当的色带峰,标记多肽的保留时间比未标记的多肽长。
5. 产品冷冻干燥成粉末或在水溶液中,-20℃避光储存;必要时可用质谱表征。
6.cydye标记的蛋白稳定性取决于蛋白本身。例如标记的igg在4 ℃可避光保存2月;更长期的保存需加入等体积的甘油-20 ℃避光保存。
f/p计算:
cy5 在650 nm 的摩尔吸光系数为250 000 m-1cm-1,所用蛋白在280 nm处的摩尔吸光系数为170 000 m-1cm-1;cy5在280nm处的吸收是650nm处的5%。按以下公式计算f/p值。
[cy5 dye] = (a650)/250 000
[peptide] =[a280-(0.05×a650)]/170 000
f/p final= [dye]/[peptide]= {0.68×a650}/ {a280- (0.05×a650)}
name | cy5 se | ||
---|---|---|---|
cat# | 1054-1 mg | cas# | n/a |
storage# | −20°c干燥避光保存 | shelf life# | 12months |
ex(nm)# | 646 | em(nm)# | 664 |
mw# | 791.99 | solvent# | water or dmso |
name | cy5 se |
---|---|
cat# | 1054-1 mg |
cas# | n/a |
storage# | −20°c干燥避光保存 |
shelf life# | 12months |
ex(nm)# | 646 |
em(nm)# | 664 |
mw# | 791.99 |
solvent# | water or dmso |