super green i 核酸染料
本品用 dmso 溶解,因为 dmso 溶点是 18.3℃,使用前请放置到室温充分溶解。
super green i 核酸染料特点:
1. 无毒性:花菁染料,无致癌毒性。
2. 高灵敏:紫外凝胶透射仪下灵敏度高 eb 染色法 5-10 倍,可见光透射仪下的灵敏度比 eb 染色法高20~30 倍。
3. 信噪比高:样品荧光信号强,无背景信号。
4. 操作简单:无须脱色或冲洗,即可用紫外凝胶透射仪观察或可见光透射仪观察。
5. 适用范围广:可适用于多种电泳分析,如琼脂糖凝胶电泳和 page 凝胶电泳。
6. 使用方便:不影响其它修饰酶作用(如:taq 酶、内切酶、t4 连接酶、反转录酶等)。
super green i 核酸染料使用方法:
1.胶染法(用法同eb)(推荐方法,见图1)
1) 制胶时加入 super green i 核酸染料。冷却胶到 50℃左右,每 100ml 胶中加入1-3µl sybr green i 核酸染料(见图 1)。
2) 按照常规方法进行电泳即可。
3) 用紫外凝胶透射仪或可见光透射仪观测。蓝光可透过玻璃, 观测聚丙烯酰胺凝胶时,可直接将托有凝胶的玻璃平皿放入可见光透射仪内观测。
*注:此方法染色能准确确定片段分子量且用量较少。1ml 染料可以做 1000 块10 ml 胶,每块胶点 50 个样,可做 50000 次。
2.点染法(见图3)
1) 该方法适于琼脂糖凝胶电泳和page凝胶电泳。
2) 工作液的配制:用电泳缓冲液将10000×的super green i 稀释100倍,即为super green i 工作液。super green i 工作液可以置2~8℃保存一个月以上, 浓缩液在-20℃保存半年。
3) 制胶:按常规方法制胶,不含任何染料。
4) 样品染色:向分析样品中加入super green i工作液和载样缓冲液,室温放置10分钟,使super green i与样品中dna充分结合。super green i 工作液加入量为总上样量的1/5~1/10。
5) dna marker染色:将5μl dna marker、5μl dna marker稀释液和1μlsuper green i 工作液混匀,室温放置5分钟,使super green i 与dna充分结合。
6) 上样、电泳:按常规操作。用紫外凝胶透射仪或可见光透射仪观测。蓝光可透过玻璃, 观测聚丙烯酰胺凝胶时,可直接将托有凝胶的玻璃平皿放入可见光透射仪内观测。
*注:用点染法染色时,灵敏度最高,染料用量最少。通常点一个样加入 1µl 即 可,可以使用 10000 次, 但大片段稍有滞后现象,如果需要更准确确定分子量(与marker 对比),建议使用胶染法。
3.泡染法
1) 按照常规方法进行制胶,其中不含任何染料。
2) 用 ph 7.0 - 8.5 的缓冲液(如:tae, tbe),按照 1﹕1000 的比例稀释 sybr green i
3) 核酸染料,混匀,制成染色溶液。
4) 将染色溶液倒入合适的聚丙烯容器中,放入凝胶,用铝箔等盖住容器使染料避光。 室温振荡染色 10-30 分钟,染色时间因凝胶浓度和厚度而定。聚丙烯酰胺凝胶直 接在玻璃平皿上染色,将配好的稀释溶液轻轻地倒在胶板上,让稀释液均匀地覆 盖整个胶板,并染色 30 分钟。玻璃平皿必须预先经过硅烷化溶液处理(避免染料 吸附在玻璃表面上)。
5) 用紫外凝胶透射仪或可见光透射仪观测。蓝光可透过玻璃, 观测聚丙烯酰胺凝胶时,可直接将托有凝胶的玻璃平皿放入可见光透射仪内观测。
*注:用泡染方法染色时,可以精确确定核酸片段分子量。但染料用量是三种方法中用量最大的。
几种染色方法特点比较:
染色方法 特点 | 灵敏度 | 染料用量 | 确定片段分子量精确度 |
胶染法 | 较高 | 较少 | 较高 |
点染法 | 很高 | 最少 | 大片段稍有滞后 |
泡染法 | 较高 | 最多 | 最高 |
点染胶染法 | 最高 | 较多 | 大片段稍有滞后 |
super green i 核酸染料使用注意事项:
1. super green核酸染料样品点染方法中,电泳不要超过 2 小时,以免核酸染料从 dna/rna 上分离出来,产生弥散状条带。
2. 用点染方法染色时,条带稍有滞后现象,如果需要确定片段精确分子量(和 marker 对比),建议用胶染法和泡染法。
3. 常规用酒精沉淀核酸过程中,super green i 核酸染料可以全部从核酸上去掉。
4. dna电泳请选择 sybr green i 染料,rna 电泳请选择 sybr green ii染料,两种染料不通用。
5. super green i 核酸染料对玻璃和非聚丙烯材料具有一定亲合力。建议在稀释、贮存、染 色等使用过程中用聚丙烯类容器。
6. 可以加orange red 作为标记. ph值在7.5-8.3之间,不要微波加热,加入热胶的温度低于50度
super green i 核酸染料不同使用方法电泳图谱:
eb super green i dna stain eb super green i
fig.1胶染法fig.1 dna marker 2000 10, 5, 2.5 per lane fig.2胶染点染 fig.2 dna marker 2000 incubate at rt for 3~5min
eb super green i dna stain eb super green ii rna stain
fig3. 点染法fig.3 volume ration of dye/dna marker 2000 fig.4 incubate at rt for 3~5min then load 0.5,1,1ug per lane
=1:10 incubate at rt for 3~5min then load 5,2,1ul per lane. fig4. sybr green ii点染(rna)
name | super green i 核酸染料(10,000× dmso溶液,效果同sybr green)(电泳级) | ||
---|---|---|---|
cat# | 001-100ul | cas# | n/a |
storage# | 4°c干燥避光保存 | shelf life# | 12个月 |
ex(nm)# | 497 | em(nm)# | 525 |
mw# | n/a | solvent# | dmso |
name | super green i 核酸染料(10,000× dmso溶液,效果同sybr green)(电泳级) |
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cat# | 001-100ul |
cas# | n/a |
storage# | 4°c干燥避光保存 |
shelf life# | 12个月 |
ex(nm)# | 497 |
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mw# | n/a |
solvent# | dmso |