1. 产品简介:
菁染料是性能优良的荧光标记染料,摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的,其琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂,广泛用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度, 可改变其荧光发射波长,每增加一个双键,按照huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料cy3和cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物;另外,cy5, cy5.5和cy7的吸收在近红外区背景非常低,是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。其中本公司的cy3 se的商标名称safered,未经授权严禁使用!
2. 菁染料琥珀酰亚胺酯(cydye nhs)的标记
菁染料和生物分子的比例f/p=4~12之间荧光强度最高,f/p值过高荧光探针会自我淬灭并影响生物分子的生物活性,标记生物分子最好是用单琥珀酰亚胺酯,但是用双修饰的cydye nhs并没有发现交联。cydye nhs标记抗体在ph (8.5~9.4)时10分钟f/p可达5~6,而在ph 7.0几乎不反应。我们用不同比例的cy3标记anti-glutathione-s-transferase (gst)多克隆抗体发现用1:1, 5:1, 10:1 和20:1标记时得到的f/p值分别是0.28:1, 1.16:1, 2.3:1 和4.6:1。
3. 操作步骤
3.1 水溶性cy3 nhs标记anti-gst多克隆抗体
市场上买到的抗体如果含有其它蛋白(例如serum albumin或gelatin等)或带氨基的缓冲液会影响标记,在标记前需纯化。
1. 在1 l 0.15 m nacl 溶液中透析anti-gst抗体(浓度为0.5 ml at 3 mg/ml),常温透析4小时。
2. 在4°c用新鲜的1 l 0.15 m nacl 溶液再透析过夜。
3. 第二天用1 l 0.1 m nahco3(ph 8.3)透析4小时。
4. 用0.22 μm注射器过滤头过滤抗体溶液。
5. 用0.1 m nahco3稀释少量的抗体,在280nm处测其紫外吸收值计算标记抗体的总量(igg antibody摩尔吸光系数170 000 m-1cm-1at 280 nm).
6. 用dmso配置cy3 nhs (mw 765.95)溶液浓度为10 mg/ml;计算所需体积以得到想要的cydye nhs 和抗体的比值(例如20:1),然后慢慢将其加入到抗体溶液中,同时在暗处常温缓慢搅拌45分钟。
7. 用1 l 0.15 m nacl 溶液常温避光透析4小时除去未标记上的cy3。
8. 在4°c用新鲜的1 l 0.15 m nacl 溶液再避光透析过夜。
9. 用1 l of 0.01 m pbs/ 0.01% 叠氮化钠溶液常温避光透析4小时, 在4°c常温避光再次透析过夜。
10. 用0.22 μm注射器过滤头过滤抗体溶液。
11. 用0.01 m pbs/0.01 % 叠氮化钠整数倍稀释标记抗体溶液,测量280nm(蛋白)和552nm(cy)处的紫外可见吸光度。
12. 产品冷冻干燥成粉末或在0.01 m pbs/ 0.01% 叠氮化钠溶液中,-20℃避光储存。
f/p计算:
cy3在552nm摩尔吸光系数为150 000 m-1cm-1;此蛋白在280nm的摩尔吸光系数为170 000 m-1cm-1;不同蛋白的摩尔吸光系数不一样;.cy3 染料本身在280 nm 的吸收是552nm处的8%。按以下公式计算f/p值。
[cy3] = a552/150000
[antibody] = {a280- (0.08×a552)}/170000
f/p final= [cy3]/[antibody]= {1.13×a552}/ {a280- (0.08×a552)}
name | cy3 se | ||
---|---|---|---|
cat# | 1051-1 mg | cas# | |
storage# | −20°c干燥避光保存 | shelf life# | 12months |
ex(nm)# | 548 | em(nm)# | 562 |
mw# | 765.95 | solvent# | water or dmso |
name | cy3 se |
---|---|
cat# | 1051-1 mg |
cas# | |
storage# | −20°c干燥避光保存 |
shelf life# | 12months |
ex(nm)# | 548 |
em(nm)# | 562 |
mw# | 765.95 |
solvent# | water or dmso |